在污水處理中往往不會只存在一種污染物質，而是多種污染物質共存，而大部分污水中都會同時存在COD和氨氮超標的問題，那么，兩者可以同時處理嗎？還是需要先處理哪一個呢？
理論上是需要先去除BOD，再降解氨氮。即先碳化再硝化。好氧細菌和硝化細菌繁殖的時代時間相差比較大，所以當bod成為瓶頸之后，硝化細菌才能大量繁殖，氨氮才會大量降解，這個主要看什么是優勢菌種了。
但在實際運行中是可以同現兩者同時進行的，也就是說氨氮的最終去除也會伴隨著COD的去除，反硝化細菌消耗碳源，將氮氮轉化為硝態氮。
具體來說是在生化處理過程中，COD可以作為去除氨氮的碳元素，但是氨氮在處理過程中并不是簡單地一步處理，而是需要通過氨化、硝化和反硝化三個階段才能徹底去除，而如果只是前面兩個階段也只是把氨氮轉化為其它氮的形態，將其徹底去除即去除污水中的總氮反硝化是少不了的。而在反硝化過程中需要消耗一定的碳源，所以在去除氨氮的同時，也會降低COD的含量。
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